Oncomine数据挖掘文献分享
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  • 侯黎
  • 2018-09-05 20:16:26 0

今天为大家介绍一篇关于Oncomine数据挖掘的研究文章。该文章发表在《ONCOLOGY REPORTS》杂志上。

论文标题

这篇论文的题目是“乳腺癌中DNA结合蛋白抑制剂的预后价值”。

摘要

DNA结合(ID)蛋白的抑制剂是一种具有碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构的转录因子的显性-阴性调节剂,参与调控多种基因在细胞周期中的作用。已有研究表明,ID蛋白在多种恶性肿瘤,特别是乳腺癌中的异常表达对其肿瘤的发生和发展起到关键作用。本研究通过分析可公开访问的数据库,如Oncomine、bc-GenExMiner、Kaplan-Meier绘图仪和人类蛋白质图谱,来评估ID家族成员的预后价值。研究发现,乳腺癌组织中ID2的mRNA表达显著高于正常组织,而ID1、ID3和ID4的mRNA表达则显著低于正常组织。此外,较高的ID1和ID4 mRNA表达水平与病理等级较低且淋巴结转移较少的亚组相关。生存分析显示,ID1和ID4 mRNA水平升高与乳腺癌患者存活率提高有关,尤其是对于ER阳性及Luminal A亚型的肿瘤患者。增加的ID4 mRNA表达还预示着激素受体阳性肿瘤患者或接受内分泌治疗患者的存活期延长。这些结果表明,ID蛋白在乳腺癌中作为预后指标的重要性。

研究分析

  1. ID家族基因在乳腺癌中的表达情况

    • 研究首先检查了ID家族基因在乳腺癌中的表达模式。
  2. GOBO分析

    • 通过GOBO分析进一步了解ID蛋白的功能及其在乳腺癌中的作用。
  3. 基因表达与肿瘤分级的关系

    • 分析了基因表达与肿瘤分级之间的关系,以探讨ID蛋白在不同分级中的表现。
  4. 蛋白质水平对生存的影响

    • 探讨了蛋白质水平变化对患者生存率的影响。
  5. 基因表达对生存的影响

    • 最后,研究了基因表达变化如何影响乳腺癌患者的生存率。

此次分享到此结束,希望能为大家提供有价值的参考信息。

    本文来源:图灵汇
责任编辑: : 侯黎
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