【中科院】高通量数据挖掘与分析学习班（理论+实践）

上海班：2018年10月27日至28日（26日报到）

地点：上海好望角饭店，上海市徐汇区肇嘉浜路500号5楼会议室

沈阳班：2018年11月3日至4日（2日报到）

地点：沈阳山水富丽华酒店

报名方式请参阅文末。

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学习班简介

高通量数据挖掘与分析是利用生物信息学方法从测序和芯片的高通量数据中挖掘出与研究方向相关的靶标基因（包括mRNA、miRNA、lncRNA或蛋白质）。随着高通量技术的发展，测序和芯片的成本持续下降，处理速度加快，这使得高通量技术成为科学研究的重要工具。

尽管许多科研人员已经进行了测序或芯片实验，但这些实验的结果通常只包含基础的分析，如过滤、质控、比对、定量和差异分析等。这些标准分析往往不足以全面解释研究结果。因此，掌握高通量数据挖掘的能力，能够帮助研究人员从海量数据中筛选出关键基因。

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培训目的与预期

培训目的： 学员将学习如何掌握高通量数据挖掘的能力，从大量数据中筛选出关键基因，从而更好地理解和解释研究结果。

培训预期： 通过两天的培训（半天理论课程和一天半实践操作），学员将能够独立完成基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。培训结束后，学员将获得由专业技术人员继续教育培训证书。

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培训时间和地点

培训时间： 2018年10月27日至28日，26日下午可报到。

培训地点： 上海好望角饭店，上海市徐汇区肇嘉浜路500号5楼会议室。

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组织方

理论课程主办方： 中国科学院上海分院国家级专业技术人员继续教育基地、上海嘉定先进技术创新与育成中心、医药加信息公共服务平台。

实践操作课程主办方： 上海嘉定先进技术创新与育成中心、医药加信息公共服务平台。

承办方： 上海遐锦生物科技有限公司。

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讲师简介

宋伟博士 宋伟博士在生物信息学领域有近十年的经验，擅长转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计及个性化分析等。他曾多次在上海、沈阳、济南、武汉等地举办培训班，培训对象包括医生、学生、科研工作者及生信爱好者。

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课程安排

10月27日（上午） - 第一节：基因数据库使用介绍 - 测序标准报告的解读 - NCBI Gene数据库：最权威的基因综合数据库之一 - NCBI GEO数据库：最大量的高通量公共数据库 - GEO2R工具：在线差异分析的R工具 - bioDBnet：在线基因ID转换工具 - Uniprot：最权威的蛋白综合数据库之一

10月27日（下午） - 第三节：聚类热图及pathway map图 - KEGG数据库：最权威的通路数据库 - HEMI软件：构建聚类热图的本地软件

10月28日 - 第四节：STRING工具——基因/蛋白相互作用分析（PPI） - STRING工具的使用步骤：输入、参数设置、输出等

• 第五节：cytoscape网络绘图软件（上）

  • 网络图构建
  • 节点和边属性的修改
  • 网络展示方式优化
  • 网络统计分析

• 第六节：cytoscape网络绘图软件（下）

  • 批量修改节点和边属性
  • Cytoscape常用插件：ClusterONE、BinGO
  • 答疑环节

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学习费用

10月27日上午的理论课程免费。 10月27日下午至10月28日全天：2800元/人（包含电子版教材、午餐，住宿费自理）。 复听学员只需支付500元。

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报名咨询与报名方式

咨询电话： 金老师：18917745941 王老师：13818765978

报名方式： 1. 下载并填写报名表（见附件） 2. 发送邮件至13818765978@163.com，邮件格式如下： - 姓名 - 性别 - 邮箱 - 手机 - 参加场次 - 发票抬头 - 纳税人识别号或统一社会信用代码 - 是否预订住宿 - 备注

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住宿安排

住宿： 上海好望角饭店，经济大床/商务标间：399元/间/晚（含早餐、含宽带）。 沈阳山水富丽华酒店，经济大床/标间：288元/间/晚。

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请按照以上内容进行报名并参加培训。