医学假阴性在机器学习中如何用来衡量分类模型的效果(附代码)
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  • L7
  • 2020-02-24 12:17:35 1

医学假阴性与机器学习

近期,新冠肺炎核酸检测中的“假阴性”问题引发了广泛关注。所谓假阴性,是指患者确实感染了新冠病毒,但由于检测误差,报告结果却显示为阴性。专家指出,任何检测手段都难以达到100%的准确率,出现假阴性是技术本身的局限性。

对于熟悉机器学习的读者来说,“假阴性”指的是患者实际上患病,但由于预测错误而被判断为无病。本文将探讨假阴性在机器学习中的应用及其重要性。

假阴性与预测准确性

假阴性与假阳性是评估预测模型准确性的关键指标。“真阳性”表示实际患病且被正确诊断为患病,“假阴性”则表示实际患病却被误判为未患病。“假阳性”表示实际未患病却被误诊为患病,“真阴性”则表示实际未患病且被正确诊断为未患病。

这些指标对于评估预测模型至关重要,尤其是在医学领域。例如,在糖尿病的预测中,我们可以使用朴素贝叶斯算法来实现这一目标。

朴素贝叶斯算法

朴素贝叶斯是一种基于贝叶斯定理的分类算法,其特点是假设特征之间相互独立。这种算法广泛应用于各种分类任务,包括医学诊断。

本文将以糖尿病预测为例,展示如何使用朴素贝叶斯算法进行预测。我们将使用加州大学尔湾分校提供的Pima Indians Diabetes数据库作为数据源。

实战操作

以下是具体的Python代码示例:

```python import numpy as np import pandas as pd from sklearn import modelselection, metrics from sklearn.naivebayes import GaussianNB

导入数据

dfinput = pd.readcsv("./data/diabetes.csv") print(df_input.head())

数据类型检查

print(df_input.dtypes)

数据摘要

print(df_input.describe())

分离特征与标签

X = dfinput.iloc[:, 0:8].values Y = dfinput.iloc[:, 8].values

划分训练集与测试集

testsize = 0.3 seed = 1 Xtrain, Xtest, Ytrain, Ytest = modelselection.traintestsplit(X, Y, testsize=testsize, random_state=seed)

训练模型

model = GaussianNB() model.fit(Xtrain, Ytrain)

预测

expected = Ytest predicted = model.predict(Xtest)

性能评估

print(metrics.classificationreport(expected, predicted)) print(metrics.confusionmatrix(expected, predicted)) ```

性能指标

性能指标包括准确率、精确率、召回率和F1分数,它们分别反映了模型的综合表现。

  • 准确率:所有预测正确的样本占总样本的比例。 [ text{Accuracy} = frac{TP + TN}{TP + TN + FP + FN} ]

  • 精确率:预测为正样本中实际为正样本的比例。 [ text{Precision} = frac{TP}{TP + FP} ]

  • 召回率:实际为正样本中被正确预测为正样本的比例。 [ text{Recall} = frac{TP}{TP + FN} ]

  • F1分数:精确率和召回率的调和平均数。 [ text{F1 score} = frac{2 times text{Recall} times text{Precision}}{text{Recall} + text{Precision}} ]

通过这些指标,可以全面了解模型的性能,并优化预测效果。

以上便是本文的主要内容,希望对大家有所帮助。

    本文来源:图灵汇
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