测序与芯片的高通量数据发掘与分析学习班(实际+实操+课后复习视频)
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  • 雷梦如
  • 2019-03-02 08:25:11 2

导语

医药加金牌学习班曾在全国范围内举办了多期面向科研人员、医生和研究生的课程,内容涵盖他们普遍关注的领域。这些课程因其高质量的教学和实用的操作内容受到了广泛的好评。授课教师的专业水平也得到了学员的高度认可。

培训时间与地点

时间: 2019年3月23日-24日(22日报到)
地点: 北京市东城区永外彭庄甲58号金泰绿洲酒店

报名方式

详情请见文末。

课程背景

高通量数据挖掘与分析是一种利用生物信息学手段,从芯片和测序数据中提取与研究目标最相关的靶标基因(如mRNA、miRNA、lncRNA或蛋白质)的方法。随着高通量技术的进步,测序和芯片的成本不断降低,速度加快。使用这些技术进行科研具有显著的优势,已经成为发展趋势。

尽管许多科研人员已经进行了测序或芯片实验,但测序公司提供的基础数据分析并不能全面解释数据背后的故事。因此,掌握高通量数据挖掘的能力,从海量数据中获取关键基因变得尤为重要。

培训目的

通过本次培训,学员将能够独立完成基于公共数据库的高通量数据挖掘分析,包括高通量公共数据的下载、在线差异表达分析、在线BLAST分析、基因ID转换、通路图制作、功能富集分析、蛋白质相互作用分析以及网络图构建和优化。

培训预期

经过两天的培训(半天理论课程+一天半实践操作),学员将掌握生物信息学文献分析思路和八个实用操作要点,从而能够独立完成基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。

讲师简介

宋伟博士

成就: 完成近百项软件著作权和发明专利的撰写和申请,构建了多个癌症数据库,开发了个体基因检测流程和无创唐氏筛查流程。

研究方向: 有近十年的生物信息学分析经验,擅长转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机制研究、疾病预后与基因关联分析等。熟悉Perl、R等编程语言。

培训经历: 在上海、沈阳、济南、武汉等地举办过多场培训班,对象包括医生、学生、科研人员和生物信息学爱好者。

培训方向: 包括《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等。

课程安排

第一天上午

第一节:基因数据库应用介绍 - 测序标准报告解读 - NCBI Gene数据库:权威的基因综合数据库之一 - NCBI GEO数据库:最大规模的高通量公共数据库 - GEO2R工具:在线差异分析工具 - bioDBnet:在线基因ID转换工具 - Uniprot:权威的蛋白质综合数据库之一

第二节:DAVID工具——功能富集分析 - 功能富集原理和意义 - 基因ID转换 - 基因功能注释(GO、KEGG通路) - 基因功能富集(GO、KEGG通路) - 基因功能聚类(GO、KEGG通路)

第一天下午

第三节:聚类热图及通路图制作 - KEGG数据库:权威的通路数据库 - HEMI软件:构建聚类热图的本地软件

第二天上午

第四节:STRING工具——蛋白质相互作用分析(PPI) - 蛋白质相互作用分析原理和意义 - 单个蛋白质的相互作用分析 - 多个蛋白质的相互作用分析 - STRING工具使用步骤:输入、参数设置、输出等

第五节:Cytoscape网络图制作软件(上) - 网络图构建 - 节点和边的属性调整 - 网络展示方式布局美化 - 网络统计分析

第二天下午

第六节:Cytoscape网络图制作软件(下) - 批量调整节点和边的属性 - Cytoscape常用插件:ClusterONE、BinGO - 答疑环节

学习费用

两天课程费用为2800元/人,包括会场、教材、专家讲课费和一小时串联视频等费用,住宿费自理。

优惠政策

  1. 提前确认报名并转账的,可提前拿到学习材料与发票。
  2. 三人组团报名,每人优惠100元。
  3. 四人组团报名,每人优惠200元。
  4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册。
  5. 参加过本学习班TCGA/GEO数据分析的学员可以享受半价优惠。

注意事项

  1. 携带Windows系统的电脑,苹果电脑请务必提前安装双系统。
  2. 现场禁止录音录像。

住宿安排

住宿不做强制规定,学员可自行预订附近酒店,费用自理。如有需要,请联系工作人员。

培训地点

北京市东城区永外彭庄甲58号金泰绿洲酒店。

报名咨询与联系方式

报名方式: 添加微信

报名咨询: 金老师 18917745941 王老师 13818765978

住宿安排:

北京金泰绿洲大酒店

地址:北京市东城区永外彭庄甲58号(陶然桥东北角)

普通标间/商务标间:398元/498元/间/晚(含早餐、含宽带)

备注:住宿统一安排,费用自理。办理住宿时告知前台是参加此学习班的即可,住宿费办理住宿时交给酒店前台。住宿费发票将在退房时由酒店开具。

参加过医药加金牌学习班的学员反馈

已有上千名学员通过参加医药加金牌学习班发表了SCI论文或获得了国家自然科学基金。我们提供完善的售后服务,讲师会在微信群中解答学员的技术问题。我们承诺:将持续支持您直至发表SCI论文或获得国家自然科学基金。

近期医药加学习班安排

3月9日-10日 - 上海中兴和泰酒店 - 第9期医学SCI论文撰写及发表技巧学习班 - 全国TCGA、GEO生信高通量数据挖掘专题学习班

3月23日-24日 - 北京金泰绿洲大酒店 - 第12期测序与芯片高通量数据挖掘学习班 - 肠道菌群与代谢组学课题设计及研究策略专题学习班 - 第11期实用医学统计与GraphPad绘图学习班

3月23日-25日 - 上海中兴和泰酒店 - 第12期基因编辑技术学习班

3月28日-29日 - 上海中兴和泰酒店 - 第七期中药网络药理学研究策略与实用技能培训学习班

3月29日-31日 - 上海中兴和泰酒店 - 第40期循证医学与Meta分析(含网状Meta分析)三天精讲学习班 - 第三届全国临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班 - 全国光遗传与膜片钳技术学习班 - 2019年全国科研作图高级学习班 - 第29期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班

4月13日-14日 - 上海中兴和泰酒店 - 肠道菌群与代谢组学课题设计及研究策略专题学习班

如有报名需求,请添加学习班秘书微信:yiyaojia01。

    本文来源:图灵汇
责任编辑: : 雷梦如
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通量测序学习班课后发掘芯片复习实际分析数据
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